Perpustakaan merupakan sarana pendukung proses kegiatan belajar mengajar. Oleh karena itu perpustakaan menjadi bagian yang tidak dapat dipisahkan dengan madrasah. Melihat esensi dan manfaat perpustakaan itu sendiri maka perpustakaan Madrasah Mu'allimaat Muhammadiyah Yogyakarta sudah ada sejak berdirinya Madrasah Mu'allimaat Muhammadiyah Yogyakart pada tahun 1923 sampai dengan sekarang. Perpustakaan Madrasah Mu'allimaat Muhammadiyah Yogyakarta mengalami perkembangan sangat pesat sejak tahun 1923 hingga saat ini, bagi dari segi sarana prasarana dan teknologi yang digunakan dalam pengelolaan perpustakaan.

Visi dan Misi Perpustakaan Mu'allimaat Muhammadiyah Yogyakarta

Visi :

Menjadi perpustakaan madrasah yang mampu memberikan layanan referensi informasi dan ilmu pengetahuan yang efisien dan efektif dalam rangka mencetak kader-kader Muhammadiyah.

Misi :

1. Melaksanakan layanan peminjaman, layanan referensi, serta layanan penelurusan informasi dengan bantuan teknologi informasi kepada semua pemustaka dengan menekankan pada prinsip kemudahan prosedur serta keterbaruan informasi yang diberikan untuk menunjang berbagai program madrasah.
2. Melaksanakan pembinaan dan pengembangan koleksi perpustakaan sesuai dengan perkembangan ilmu pengetahuan dan teknologi serta penyediaan jasa penelurusan informasi melalui dukungan teknologi informasi.
3. Melaksanakan penyebaran informasi tentang koleksi terbaru yang dimiliki perpustakaan dengan berbasis teknologi informasi.
4. Melaksanakan pengembangan sistem perpustakaan, tenaga perpustakaan dan kerjasama antar perpustakaan dan badan atau lembaga lain.

Perpustakaan Madrasah Mu'allimaat Muhammadiyah Yogyakarta mempunyai ± 4590 judul buku dengan layanan automasi yang cepat dan mudah dan menyediakan 13 unit komputer dengan koneksi internet yang cepat, sehingga dapat memberikan layanan informasi online, membantu dalam pembuatan tugas dan lain-lain serta tersedia juga printer untuk keperluan mencetak dokumen.

Koleksi Seputar Muhammadiyah

Inilah yang menjadi salah satu yang spesifik di Perpustakaan Madrasah Mu'allimaat Muhammadiyah Yogyakarta. koleksi seputar Muhammadiyah berisi buku-buku yang berkaitan dengan Muhammadiyah. Koleksi-koleksi ini dikhususkan mengingat banyaknya peminat buku-buku, dokumen-dokumen terkait dengan Muhammadiyah. Selain koleksi seputar Muhammadiyah, perpustakaan Madrasah Mu'allimaat Muhammadiyah Yogyakarta juga mempunyai koleksi yang lain seperti Kitab, koleksi referensi, bacaan umum, buku Islam umum, koleksi penunjang pelajaran dan koleksi-koleksi fiksi.